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Usage «avancé» OAR : array

La «bonne pratique» pour lancer massivement, en parallèle, le même programme avec des paramètres différents : **utiliser l'option --array-param-file parametres.txt d'OAR **. Cette option lance un «tableau de tâches» chacune indépendantes les unes des autres

• développer le programme de tel sorte qu'il prenne les paramètres en argument : ./programme.exe arg1 arg2 arg3...
• générer un fichier ascii qui contient l'ensemble des paramètres à tester
  • arg11 arg12 arg13 ..
  • arg21 arg22 arg23 ..

Note: ce fichier peut contenir des centaines, des milliers de lignes

• lancer les expériences via un script OAR:
  • avec l'option #OAR --array-param-file parametres.txt
  • dans la queue besteffort
  • avec l'option idempotent

Rappel: en besteffort, les ressources sont illimitées mais les jobs sont non prioritaires (ils peuvent être supprimés sans préavis si des jobs de priorité supérieure sont lancés). À noter dans ce cas que le strict nécessaire aux jobs prioritaires est «libéré»: ce n'est pas le tableau de tâches qui est intégralement supprimé. De plus, l'option idempotent permet de relancer automatiquement toutes les expériences (qui auraient été tuées par des jobs prioritaires)

exemple 1 : pi_array.oar

le programme pi.exe calcule une approximation de pi par l'intégration de f(x)=4/(1+x^2) sur [0;1]. Le nombre d'intervalles est passé en argument (regroupé dans le fichier pi_input.txt)

• make (compile le programme pi.exe)
• oarsub -S ./pi_array.oar

exemple 2 (matlab):