tutoriaux_calculco/checkpoint/checkpoint-dmtcp-openmp4.oar

#!/bin/bash

#-------------------  CHECKPOINT DMTCP OpenMP ex4 --------------------------- 
#
#  Programme test de dmtcp dans le cas Multithreads (OpenMP)
#    - 20 multiplications matricielles (2000x2000)
#    - avec 8 threads le temps est un peu plus de 4 minutes
#    - le programme est lancer avec l'option -i 180s
#  de dmtcp (un checkpoint au bout de 3mn)
#   - comme dans l'exemple checkpoint-dmtcp1.oar, le walltime du script
#  OAR est "trop court" : il ne finit pas son execution
#   - => il faut relancer le script une deuxième fois (manuellement)
#  le (ce) script qui recharger le script dmtcp_restart_script.sh

# commande: oarsub -S ./checkpoint-dmtcp-openmp4.oar

# infos: http://dmtcp.sourceforge.net/

# IMPORTANT : la reprise de job se fait ici sur le même noeud,
#  merci de consulter la charge sur cluster (noeud libre) sur
#  https://www-calculco.univ-littoral.fr/outils_visu/drawgantt/
#  et EDITER la ligne: OAR -p network_address = 'orval06'
#  (un peu plus bas)

#-------------- paramètres OAR---------------------------

# walltime de 6mn ( donc trop court pour le prog/timer de 10mn)
#OAR -l core=8,walltime=00:3:30 
#OAR -n dmtcp_ex4

# Les fichiers de sortie sans parametres $OAR_JOBID
# (=> les jobs successifs ecrivent dans les memes fichiers)

#OAR -O OAR-ckpt-dmtcp4.out
#OAR -E OAR-ckpt-dmtcp4.err

#OAR -q default


# les tests sont mis au point sur orval06.
# Note: une reprise de checkpoint sur une autre machine nécessite
# l'édition du script dmtcp_restart_script.sh 
#  A EDITER en fonction de la charge: https://www-calculco.univ-littoral.fr/outils_visu/drawgantt/
#OAR -p network_address = 'orval06' 

# optionnel
##OAR -t besteffort

# chargement du modeul dmtcp
source /nfs/opt/env/env.sh > /dev/null 2>&1
module load dmtcp  > /dev/null 2>&1

#---------- la tâche à exécuter   ------------------------ 
# compilation (  ) 
gfortran -fopenmp -O3 timing-matmul2000.f90 -o matmul2000
#----------- pré-traitement -----------------------------
# DWTFYW !
 

echo "Debut du jobs ou restart ?"

# si c'est une reprise
if [ -f dmtcp_restart_script.sh ]; then
    echo "  -> reprise du job "
    # piste (changement de nœuds): sed -i '/ancien_noeud/nouveau_noeud/' dmtcp_restart_script.sh
    # (-> testé -OK- a la mano, à scripter!)
    ./dmtcp_restart_script.sh 
else
    # 1er démarrage avec ordre de checkpoint toutes les 2mn 50 (walltime 3mn) 
    # Rq: sur un vrai exemple, prendre plus de marge!
    echo "  -> Debut du jobs"
    dmtcp_launch -i 180 ./matmul2000
     # pas d'eperluette! (&) sinon le script OAR checkpoint supprimes cf plus bas
fi

#---------------------------------------------------------
# fin du programme:  postraitement 
#---------------------------------------------------------
# DWTFYW!
echo "---post treatement---"
# suppression des ckpt (ménage)
echo "fin effective du programme, suppression des checkpoints"
rm ckpt_*.dmtcp dmtcp_restart_script*

exit $?