tutoriaux_calculco/checkpoint/checkpoint-user1bis.oar

#!/bin/bash

#-------------------  CHECKPOINT  --------------------------- 

#
#  exemple de programme qui vient illustrer le cas décrit : 
# https://www-calculco.univ-littoral.fr/utilisation/lancer-un-calcul#h2-2-oardel

# commande: oarsub -S ./checkpoint-user1bis.oar

# cet exemple reprend l'exemple exemple 1 (checkpoint-user1.oar)
# avec un programmer timer de 4mn 
# simplement c'est l'utilisateur qui déclencle le checkpoint
# en supprimant son job avec la commande:

#    oardel -c -s SIGUSR2 XXXXX, où XXXX est le n° du job (JobID)
# 

#   Le checkpoint crée le fichier context_compteur.txt. Relancer le
#   script OAR ultérieurement entraîne un reprise du programme à
#   partir de ce contexte.

# 
#-------------- paramètres OAR---------------------------
#OAR -l cpu=1/core=1,walltime=00:5:00 
#OAR -n checkpoint-user1bis

# Les fichiers de sortie sans paramètres $OAR_JOBID
# (=> les jobs successifs écrivent dans les mêmes fichiers)
#OAR -O OAR-ckpt-user1bis.out
#OAR -E OAR-ckpt-user1bis.err

#OAR -q default


#IMPORTANT:
#   - par NFS: a priori pas de problème
#   - sur SCRATCH : il faut reprendre sur la même machine
#  par exemple : 
##OAR -p network_address = 'orval08' 
## besteffort est optionnel 
#OAR -t besteffort

# signal envoyé par OAR (SIGUSR2)
#OAR --signal 12 

#---------- la tâche à exécuter   ------------------------ 
# compilation ( peut être commenté si déjà compilé) 
gcc compteur4mn.c  -o timer4mn
# Note (compteur4mn.c): gère son propre checkpoint (SIGINT)
#----------- pré-traitement -----------------------------
# DWTFYW !
echo "Debut du job ${OAR_JOB_ID}"

#----------- lancement de la tâche ----------------------
./timer4mn &

#---------------------------------------------------------
# gestion de signaux
#---------------------------------------------------------
# Warning: c'est le script OAR qui reçoit le signal 12!
#  => il faut le capter et le transmettre au PROG
####################################################

# pid du programme = pid de la dernière commande (: ./timer10mn)

PROGPID=$!

echo "le PROG PID est : $PROGPID"

# fonction de traitement du signal OAR
sighandler() {
    echo "reception checkpoint OAR (signal12)"
    # demande de checkpoint (-c) au programme
    # SIGINT = 2 = "CRTL + C" (cf compteur10mn.c)
    kill -s 2 $PROGPID
    # IMPORTANT: pause (creation du fichier contexte)
    sleep 5
    [ -n "$PROGPID" ] && kill -9 $PROGPID
    SCRIPT_CHECKPOINTED="YES"
    echo "checkpoint : $SCRIPT_CHECKPOINTED"
    }

# signal Unix attendu par OAR (defaut = SIGUSR1/10, forcé ici
# à 12 par le paramètre --signal 12 (cf. param OAR au début)
CHKPNT_SIGNAL=12

# valeur de sortie en cas de checlpoint :
# on laisse la valeur 99 nécessaire à l'option "--idempotent"
# (restart automatique)
# Dans le cas manuel, cette valeur peut être autre, l'important
# est d'en fixer une pour sortir du programme sans aller à la fin
# du script OAR (sinon le contexte est suppimé . cf les dernières lignes) 
EXIT_UNFINISHED=99

# si le script OAR reçoit le SIGUSR2 (signal 12), checkpoint!

# indique au script OAR de capter le signal 12 
trap sighandler  $CHKPNT_SIGNAL

# wait indispensable pour maintien des communucations
# (signaux) entre ce script et le PROG
while kill -0 "$PROGPID" 2>/dev/null; do
    wait $PROGPID
done

# sortir ici ( sinon suppression du fichier context_compteur.txt )
[ -n "$SCRIPT_CHECKPOINTED" ] && exit $EXIT_UNFINISHED

#---------------------------------------------------------
# fin du programme:  postraitement
#---------------------------------------------------------
# DWTFYW!
echo " ---post treatement---"
echo " ...suppression du fichier temporaire context_compteur.txt"
rm -f context_compteur.txt
echo " c'est FINI ! "
exit $?